Analyse bio-informatique et statistique des données de séquençage

À qui s’adresse ce service ?

Ce service est destiné aux laboratoires et entreprises ayant réalisé un séquençage du microbiote
auprès d’un prestataire et nécessitant une expertise externe pour l’analyse des données.

Ce que comprend la prestation de base

• Analyse bio-informatique : évaluation de la qualité de séquençage; filtrage et assemblage

des séquences; classification des micro-organismes et/ou de leurs fonctions.

• Analyse statistique simple : test de diversité alpha/beta en fonction du groupe expérimental;
identification de taxons/fonctions indicatrices du groupe expérimental; pas de prise en compte d’autres facteurs expérimentaux.

• Soumission aux plateformes publiques : dépôt des données brutes sur NCBI; partage des scripts et données intermédiaires sur Figshare, GitHub…

• Rapport de recherche : rédaction d’un rapport structuré en français ou en anglais; présentation des résultats et méthodologies;
intégration de l’interprétation scientifique si l’option correspondante a été choisie.

⏳ Durée estimée : 15 jours ouvrés

Services en option

• Analyse statistique complexe : prise en compte de variables expérimentales supplémentaires (cholestérolémie, glycémie, traitements annexes…);
modèles statistiques plus complets et machine learning (glm, random forest…); analyse de réseau; approche personnalisée selon la littérature.

⏳ Durée estimée : 10 à 25 jours ouvrés selon les demandes

• Interprétation scientifique approfondie : analyse des résultats à la lumière des connaissances scientifiques existantes;
recherche bibliographique sur les indicateurs identifiés et leurs liens avec les facteurs biologiques étudiés.

⏳ Durée estimée : 5 à 15 jours ouvrés selon les besoins

Mes prestations étant entièrement sur mesure, chaque tarif fait l'objet d'un
devis personnalisé. Pour initier votre projet, cliquez sur le bouton ci-dessous.

Devis et tarifs sur mesure

Pour un aperçu détaillé de toutes mes prestations,
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