Formation en programmation et analyse de données

Ces formations s’adressent à toute personne souhaitant acquérir des compétences en programmation, 
en analyse de données ou sur les principes biologiques du microbiote, quel que soit son niveau.

Modules de formation disponibles

•  Introduction à la programmation : concepts fondamentaux de la programmation; 
syntaxe et logique de programmation; organisation du code en fonctions; types de variables, etc.

📌 Prérequis : aucun 
⏳Durée : 1,5 jour 

•  Bases de programmation Unix/Shell et R : utilisation du terminal et des commandes de base; 
écriture de scripts shell/unix (gestion de fichiers, automatisation…); 
découverte de l’environnement R : organisation en packages, types de variables, syntaxe; 
prise en main de Rstudio; lecture, manipulation et exécution de scripts R.

📌 Prérequis : des notions de programmation sont recommandées 
⏳ Durée : 2 jours

•  Visualisation graphique dans R : principes de visualisation des données; 
choix des représentations graphiques adaptées; création et personnalisation de graphiques sous R.

📌 Prérequis : bases de programmation et notions en R 
⏳ Durée : 1,5 jour 

•  Principes d’écologie microbienne : fondements biologiques du microbiote; 
biologie des bactéries et interactions avec l’hôte; méthodes d’étude du microbiote.

📌 Prérequis : aucun 
⏳ Durée : 1,5 jour 

• Analyse de données de séquençage 16S : principes et enjeux de l’analyse 16S; formats et prétraitement des données; 
filtrage qualité et classification taxonomique; analyses statistiques; visualisation et interprétation des résultats.

📌 Prérequis : bases en programmation, R et utilisation du terminal de commandes